Après sa régénération explosive, le Onzième Docteur est propulsé dans le Londres de 1996. Celui-ci fait la connaissance d'une jeune londonienne, Amy Pond, qui devient son assistante. Bientôt rejoint par Rory Williams, petit ami de cette dernière, il se retrouve confronté à l'omniprésence de failles spatio-temporelles menaçant l'univers tout entier. S'ajoutent à cela le retour d'anciens ennemis pour affirmer que les nouvelles aventures du Docteur ne seront pas de tout repos...
Épisode 1
Le Tardis, endommagé par la récente régénération du Docteur, s écrase sur Terre. Le nouveau docteur a tout juste vingt minutes pour sauver le monde des Atraxi mais heureusement une jeune femme nommée Amy Pond est là pour l'aider...
Épisode 2
Amy fait son premier voyage à bord du Tardis. Le Docteur l'emmène au XXIXe siècle sur le « Starship UK », un vaisseau-colonie terrien embarquant toute la population britannique, qui a quittée la planète à la suite d'éruptions solaires dévastatrices. Mais ce vaisseau pourrait cependant abriter bien plus que des Britanniques et de terrifiants automates...
Épisode 3
Le Docteur et Amy Pond répondent à un appel de Winston Churchill durant la Seconde Guerre mondiale. Cependant, la nouvelle arme secrète des Britanniques pourrait bien être leur pire ennemi et celui du Docteur : les Daleks...
Épisode 4
River Song est de retour dans la vie du Docteur. Et elle a grandement besoin de son aide pour capturer une proie particulière, un ange pleureur, unique rescapé du crash du vaisseau « Byzantium »...
Épisode 5
Le Docteur, Amy et River Song sont toujours à la poursuite des anges pleureurs. Rapidement, ils réalisent qu'ils sont sérieusement menacés par un danger beaucoup plus grand...
Épisode 6
Le Docteur emmène Amy et Rory dans la Venise du XVIe siècle pour une escapade des plus romantiques. Cependant, ils constatent très vite que la terreur règne dans la ville. Quel secret est caché par la maison Calvierri ?...
Épisode 7
Un univers dans lequel Amy Pond attend un enfant de Rory Williams et où il sont confrontés avec le Docteur à de dangereux vieillards. Un autre dans lequel le TARDIS est sur le point de s'écraser sur une étoile. Lequel des deux est un rêve ?...
Épisode 8
Amy, Rory et le Docteur sont entraînés par le TARDIS dans un village gallois en 2020. Le Docteur découvre que l'installation d'une plate-forme de forage est devenue une source de nuisance pour un peuple de reptiles en hibernation sous terre...
Épisode 9
Le Docteur tente d'éviter une guerre entre les Siluriens et les humains. Mais la rancœur et la vengeance menacent les pourparlers...
Épisode 10
Le Docteur emmène Amy au musée d'Orsay. Un détail incongru dans la toile « L'Église d'Auvers-sur-Oise » de Vincent Van Gogh attire l'œil du Docteur. Il décide de voyager dans le temps pour s'entretenir avec le célèbre peintre...
Épisode 11
Une force inconnue empêche le TARDIS de se matérialiser. Le Docteur en est éjecté tandis qu'Amy est encore à l'intérieur. Celui-ci va devoir enquêter sur une mystérieuse maison à l'origine de ses ennuis en se faisant passer pour un humain...
Épisode 12
Le Docteur, Amy Pond et River Song, avertis par une peinture de van Gogh montrant l'explosion du TARDIS, se rendent à Stonehenge. Ils y découvrent un objet mythique, la Pandorica. Alors que celle-ci est sur le point de s'ouvrir, une conjuration des ennemis du Docteur est à l'œuvre...
Épisode 13
Le Docteur est coincé dans la Pandorica, le TARDIS explose tandis que River Song est à l'intérieur, Amy Pond est morte, Rory Williams est un Auton et l'Univers s'éteint autour de la Terre. Le seul espoir de l'Univers est une petite fille qui croit encore aux étoiles...